玄武门之变，是唐高祖武德九年六月初四(公元626年7月2日)，由当时唐高祖李渊次子秦王李世民在唐王朝的首都长安城(今陕西省西安)太极宫的北宫门--玄武门附近发动的一次军事政变。李渊在很早的时候，就确立了李建成为太子，一方面李建成是长子，这符合礼制，另一方面李建成是个仁厚、有才能之人，这样做无任何不妥，但不幸的是，他还有另一个手握实权、功勋卓著的儿子李世民 ，李建成在宫内协助李渊管理宫务，李世民则率领武将集团带兵出征，功劳也最大。老三李玄霸年仅16岁就过早夭亡，还有一老四齐王李元吉，这个李元吉是最不争气的一个，年纪虽小却一肚子坏心眼，当初跟随秦王四处征战，但未曾立下寸功，甚至还和李世民争帅统兵，结果大败而归。李世民却每次都能大获全胜，这让李元吉心生妒恨，处处为难李世民，后来干脆投靠了太子李建成。

回观整个玄武门事件始末，其实一切都是李元吉在暗地里唆使李建成而导致的恶果，自己最小储君之位怎么也轮不到自己，假如哥哥们斗个两败俱伤，只有他是最受益的人，李建成杀了李世民就帮他出了口气，李世民杀了太子李建成就会以弑君之罪被处死，所以就向太子表决心：现如今秦王势力愈发强大，唯恐对太子储位有莫大的危险，应及早除掉才是，我可以亲自帮太子杀了秦王。可是万万没想到的是，他们密谋的风声被秦王得知。

武德九年六月四日，即公元626年7月2日，秦王李世民向唐高祖李渊告发李建成和李元吉的阴谋。听了李世民的的告密之后，李渊决定次日当面询问李建成和李元吉两人。当李建成获知阴谋败露之后，决定先进入皇宫，进而逼迫李渊表态。可李建成没想到的是：李世民比他先动手了，在与其手下的谋臣几经商议，决定在上朝的路上行动，地点选择了玄武门。问题又出现了，高祖早早就将重要的几个门派了自己的心腹担任，玄武门安全的军官分别是常何、吕世衡、敬君弘。李世民看了半天，这该这么下手？连门都进不去？于是李世民开始各种公关，亲自到常何府上拜访，但是常何是太子李建成的人，没办法，那就赌一把，在李世民的几经分析后，常何动摇了，当起了双面间谍角色。

六月四日，公谨与长孙无忌等九人伏于玄武门以俟变。太子李建成与齐王李元吉一如往常经过玄武门，等他们一进入城门内，常何便下令关闭城门，来了一出关门打狗的戏码，皇宫内的兄弟相残开始了，感觉不对劲的李建成与李元吉及其部下，迅速向玄武门靠拢，试图从混乱的对峙中解救出各自的主人，李世民张弓搭箭首先将太子李建成射于马下，被乱成一团马匹踩死，李元吉见此情景正欲逃走，李元吉心虚，先张弓搭箭射向李世民，但由于心急，一连两三次都没有将弓拉满，箭没有射中。李世民却搭弓射向李建成，将他射死了。 尉迟恭带领骑兵七十人相继赶到，他身边的将士用箭射中了李元吉，李元吉跌下马来。可就在此时，李世民的坐骑受到了惊吓，带着李世民奔入玄武门旁边的树林，李世民又被林中的树枝挂住，从马上摔下，倒在地上，一时爬不起来。 李元吉迅速赶到，夺过弓来，准备勒死李世民，就在这时尉迟恭跃马奔来大声喝住了他。李元吉知道不是对手，赶紧放开李世民，想快步跑入武德殿寻求父皇庇护，但尉迟恭快马追上他，放箭将他射死了。

对于兄弟三人的争斗，秦琼既没有参与其中，也没有说过与此相关的任何言论。李世民曾派程咬金去劝说秦琼，而秦琼则只是拿出了李渊送给他的一个金酒壶，其意不言自明，食君禄，忠君事，程咬金是一聪明之人，他自然能看懂其中之意，他们是大唐臣子，所得的一切皆被李渊所赐。因此，他们不能做不忠君之事。